Ubicado frente a la ciudad de Puntarenas, el Estero de Puntarenas cubre 52,4 km² y contiene uno de los sistemas de humedales de manglar más importantes del Pacífico Central de Costa Rica. El estuario y los manglares se pueden explorar en barco, kayak o tabla de surf a remo gracias a sus aguas tranquilas. La observación de aves es popular, ya que más de 50 especies anidan allí, incluyendo la espátula rosada, una especie en peligro de extinción. Varias especies de peces, crustáceos, anélidos y moluscos habitan en las aguas entre mareas y marismas.